報(bào) 告 人：陳國(guó)波 副研究員

報(bào)告題目：大規(guī)模醫(yī)學(xué)遺傳數(shù)據(jù)分析與實(shí)踐

報(bào)告時(shí)間：2023年6月9日（周五）上午9：00

報(bào)告地點(diǎn)：靜遠(yuǎn)樓1506

主辦單位：數(shù)學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)院、數(shù)學(xué)研究院、科學(xué)技術(shù)研究院

報(bào)告人簡(jiǎn)介：

       陳國(guó)波，2009年浙江大學(xué)數(shù)量遺傳學(xué)博士，2011~2015年澳大利亞昆士蘭大學(xué)大腦研究所博士后。2017年至今，浙江省人民醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究所副研究員。從事統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)研究，在Nature,Lancet,Am J Hum Genet,Hum Mol Genet,Bioinformatics,Mol Ecology等雜志發(fā)表論文40余篇，Google Scholar引用超3200次，H-index 19。 

報(bào)告摘要：

       醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)逐漸涌現(xiàn)為數(shù)據(jù)挖掘與分析的重要場(chǎng)景，尤其DNA測(cè)序數(shù)據(jù)結(jié)合表型數(shù)據(jù)構(gòu)成全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-wide association studies，GWAS）的規(guī)范數(shù)據(jù)格式，直接可以作為各類(lèi)醫(yī)學(xué)預(yù)測(cè)的數(shù)據(jù)源。但醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)和DNA數(shù)據(jù)受到隱私保護(hù)的各類(lèi)限制，現(xiàn)實(shí)中很難直接使用或者交互，極大限制了數(shù)據(jù)體量的擴(kuò)增。本研究采用隨機(jī)矩陣的計(jì)算框架，采用projection的方式，對(duì)基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行單向哈希加密，精準(zhǔn)測(cè)算projection所需要的維度k與最終求解精度的量化關(guān)系，開(kāi)發(fā)出適用于多方計(jì)算的encG-reg（encrypted genotype regression）。以?xún)煞菡鎸?shí)世界的UKBiobank的約50萬(wàn)GWAS樣本以及中國(guó)本土6個(gè)基因組相關(guān)研究所的約6萬(wàn)份GWAS樣本，展示了如何在多方計(jì)算下采用encG-reg完成醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)的親屬鑒定，以及將要展開(kāi)的進(jìn)一步工作內(nèi)容和數(shù)據(jù)分析層面的各類(lèi)挑戰(zhàn)。